Процедура получения спермы для ИКСИ обычно бывает успешной, поскольку у всех пациентов с обструктивной и половины с необструктивной азооспермией в яичках или прилежащих придатках яичек имеются сперматозоиды.

С целью выявления обструкции семявыносящих путей, а также для того чтобы определить, можно ли произвести забор спермы у данного пациента под местной анестезией либо потребуется наркоз, проводится клиническое исследование. Для цикла ИКСИ необходимо всего несколько зрелых мужских половых клеток, поэтому одна процедура аспирации спермы обеспечивает достаточное количество спермиев для трех и более циклов. Их хранят в морозильных камерах, погружая в жидкий азот.
Обследование яичек у пациента с обструктивной азооспермией иногда выявляет небольшую кисту (1-2 см) около придатка яичка - сперматоцеле. Это тонкостенное образование обычно заполнено прозрачной или мутноватой жидкостью, которая может быть аспирирована с помощью шприца и тонкой иглы без местной анестезии.
В данной жидкости под микроскопом часто обнаруживаются живые сперматозоиды. Подобные мелкие сперматоцеле выявляются у одного из 25 мужчин с обструктивным бесплодием, что обычно позволяет получить достаточное количество жизнеспособных спермиев и избежать более инвазивных процедур аспирации спермы.